以下のアイテムは入手方法が限られているレアアイテムです。残せる上限も99とは限りません。シナリオを進めながら集めておきましょう。

　　　レアアイテム（最終上限数）
リング（1）フィン
カヌー（1）アルテア
ミスリル（1）セミテの滝の洞窟
つうこうしょう（1）バフスクの洞窟
せつじょうせん（1）セミテの滝の洞窟
こだいのつるぎ（1）PSP版は（99）雪原の洞窟
めがみのベル（1）雪原の洞窟
エギルのたいまつ（1）カシュオーン城
たいようのほのお（1）カシュオーン城
ねむりのけん（1）PSP版は（99）大戦艦
くらやみのゆみ（1）大戦艦（FC版はもうもくのゆみ）
マインゴーシュ（1）PSP版は（99）大戦艦
せいじゃのこころ（4）ディスト、ディストの洞窟、パラメキア城。アスタロート
ペンダント（1）ディストの洞窟
ひりゅうのたまご（1）ディスト
ブレイクのほん（1）PSP版は（99）フィン城
ほのおのたて（2）PSP版は（99）フィン城地下、ミシディアの塔
ブラッドソード（2）GBA版は（1）フィン城地下、フィンの町
しろいかめん（1）フィン城地下
くろいかめん（1）南の島
ちんもくのかね（1）PSP版は（99）ミシディアの洞窟
クリスタルロッド（1）ミシディアの洞窟
だいちのつるぎ（1）リバイアサン
しろのローブ（2）ミシディアの塔。アスタロート
ほのおのかぶと（1）ミシディアの塔
アイスランス（1）PSP版は（99）ミシディアの塔
こおりのこて（1）ミシディアの塔
アイスアーマー（1）ミシディアの塔
アルテマのほん（1）ミシディアの塔
ひりゅう（1）フィン城
ディフェンダー（2）竜巻。こうてい①
ダイヤアーマー（3）竜巻、レオンハルト。こうてい①
ダイヤメイス（1）ジェイド
マサムネ（1）GBA版は（99）パンデモニウム
ひかりのつえ（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
ドラゴンクロー（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
グングニル（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
ダンシングダガー（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
ランスオブアベル（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
ロンギヌス（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
アルテミスのゆみ（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
ギガントアクス（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
ラグナロク（99）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
きぼうのひかり（1）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
リバイヴのほん（1）秘紋の迷宮（PSP版のみ）
デストロのほん（1）（PSP版のみ）
ひりゅうのやり（1）謎の迷宮（GBA版のみ）
ワイルドローズ（1）謎の迷宮（GBA版のみ）
ほしくずのロッド（1）謎の迷宮（GBA版のみ）
ブレイサー（1）謎の迷宮（GBA版のみ）